120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0024 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0024  tRNA-Trp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08670  tRNA-Trp  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000627266  hitchhiker  0.0000000142101 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0644  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0685  tRNA-Trp  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000025208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0033  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0032  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0019  tRNA-Trp  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805643  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0018  tRNA-Trp  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0055  tRNA-Trp  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0043  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0056  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29900  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0054  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17320  tRNA-Trp  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0017  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.735607  decreased coverage  0.0025473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0041  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000135677  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0018  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  decreased coverage  0.00256285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0005  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24010  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0823  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0144883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0017  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0959  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTrp01  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0012  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000390892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0046  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0012  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0044  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>