70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0959 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0959  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  151  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.55899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0019  tRNA-Trp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.77581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  90.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0016  tRNA-Trp  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0055  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0361577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0685  tRNA-Trp  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000025208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t08  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00447017  unclonable  0.000000239322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R86  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08690  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000355239  hitchhiker  0.00161168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0013  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00037699  normal  0.0920861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA66  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000464617  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t08  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0083  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0020  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0066  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60050  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0823  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0144883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0017  tRNA-Trp  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225393  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0010  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948194  hitchhiker  0.0000000000358204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0046  tRNA-Trp  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.590376 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0010  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000288959  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0024  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>