More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0720 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
394 aa  793    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.62 
 
 
407 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.41 
 
 
403 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  46.96 
 
 
323 aa  289  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.41 
 
 
409 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.75 
 
 
406 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  47.35 
 
 
304 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.88 
 
 
304 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
410 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.08 
 
 
312 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.73 
 
 
555 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.88 
 
 
308 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  41.9 
 
 
326 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.24 
 
 
309 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  35.25 
 
 
396 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
308 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40.89 
 
 
334 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  40.72 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.8 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  41.45 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  40.71 
 
 
321 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
321 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.98 
 
 
321 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  40.98 
 
 
321 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
327 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  40.98 
 
 
318 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  40.98 
 
 
318 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  40.92 
 
 
309 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
320 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.81 
 
 
306 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
317 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  40.33 
 
 
317 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.55 
 
 
556 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
311 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.62 
 
 
302 aa  226  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
319 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  40 
 
 
318 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  41.48 
 
 
318 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
310 aa  223  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
344 aa  222  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.54 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
308 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  41.97 
 
 
309 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
318 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  41.35 
 
 
348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  40.66 
 
 
318 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
333 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
333 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
333 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
311 aa  219  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.76 
 
 
319 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  39.3 
 
 
334 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
330 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
310 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.98 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  40.39 
 
 
311 aa  215  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  40.51 
 
 
359 aa  215  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.21 
 
 
555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.06 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  40.07 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.22 
 
 
330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.06 
 
 
312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.06 
 
 
312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  39.14 
 
 
310 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  38.54 
 
 
547 aa  212  7.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
320 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  38.36 
 
 
336 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
346 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  35.98 
 
 
340 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.41 
 
 
330 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  38.76 
 
 
353 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  38.85 
 
 
332 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  41.12 
 
 
348 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  40.52 
 
 
329 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  39.02 
 
 
310 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  41.94 
 
 
317 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
306 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  40.64 
 
 
307 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.2 
 
 
306 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  39.02 
 
 
309 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
311 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  38.76 
 
 
311 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
324 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  39.35 
 
 
318 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.7 
 
 
340 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  38.83 
 
 
456 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.79 
 
 
310 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
311 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
314 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>