More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0319 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0319  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  702    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  57.54 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.78 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2997  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.66 
 
 		 336 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.21 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2564  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  55.93 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2378  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2334  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2465  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  55.93 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2423  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2535  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.943275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2427  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2295  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  335  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575488  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02077  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1510  Monosaccharide-transporting ATPase  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.904375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02036  hypothetical protein  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2282  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0823  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.64113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2443  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1500  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.18 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3019  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  55.65 
 
 		 336 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3281  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  55.9 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.692353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2748  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  56.74 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.845248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.35 
 
 		 342 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.35 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  48.77 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2325  inner-membrane translocator  51.37 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  44.21 
 
 		 360 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2215  galactoside ABC transporter, permease protein, putative  41.31 
 
 		 564 aa  226  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0821  Monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 		 551 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  36.52 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 835 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.84 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  38.3 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.51 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.41 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.12 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.72 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.78 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.49 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.78 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.49 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.49 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.37 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  33.51 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.77 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.62 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.94 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.85 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.52 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.94 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.18 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  35.24 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  36.17 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  33.43 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  33.99 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>