257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0198 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  100 
 
 		 395 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  63.14 
 
 		 406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 391 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  34.46 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  33.86 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  35.32 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  35.18 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  31.59 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  32.62 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 410 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  34.34 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  32.56 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  31.81 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  33.25 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  33.25 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  32.25 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  30 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 408 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  29.4 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.53 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  29.53 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.53 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.53 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.98 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.68 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.68 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  28.28 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  30 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  33.23 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  31.64 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  33.44 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  31.34 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.13 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  26.87 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.37 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.16 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.16 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.16 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  25.78 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  24.93 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  24.17 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.96 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  28.32 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  25.06 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  25 
 
 		 348 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.51 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.51 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  23.96 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.56 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.02 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  23.87 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  26.18 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  24.87 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  24.47 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  25.4 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.71 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.81 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  24.12 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>