More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0185 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3675  esterase/lipase/thioesterase  46.75 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3410  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.43 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  0.629744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.87 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  34.04 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  38.39 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  32.7 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.74 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.6 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.13 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.7 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.71 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1835  acetyl esterase  31.72 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.29 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.73 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.08 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.2 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.71 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.14 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.53 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35.34 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.2 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.5 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  30.5 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.25 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  29.25 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  29.25 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.22 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.37 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  28.97 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.86 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.39 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.78 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  29.79 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  28.66 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  29.79 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.15 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.05 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.9 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  28.62 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  29.79 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.92 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  36.62 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  29.59 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3064  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.05 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000554719  hitchhiker  0.000820909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.2 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  38.2 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.32 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.23 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.61 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5060  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.72 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.14 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.62 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.21 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3151  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.39 
 
 		 349 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.27 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.72 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  32.79 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  30.77 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.19 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.19 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3592  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.43 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.82 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.1 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3965  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.54 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.59 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.51 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.32 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  32.65 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.72 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.72 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.32 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.38 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  29.47 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  29.47 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.72 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.51 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.35 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.24 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.79 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0082  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.61 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  35.18 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  33.93 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  34.86 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.08 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  30.43 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  29.15 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.93 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.48 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.93 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.63 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.37 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.84 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>