30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2623 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  100 
 
 		 295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  43.64 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  32.14 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  36.16 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  38.81 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.04 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  32.07 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  25.22 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  33.54 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  26.44 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  34.9 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  34.68 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  31.54 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  36.43 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  35.77 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  28.65 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  31.98 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  33.6 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  30.61 
 
 		 600 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>