299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5562 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  53.27 
 
 		 202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  50.76 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  49.49 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  48.74 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  48.47 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  43.96 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  43.15 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  46.84 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  41.97 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  48.47 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  45.03 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  42.02 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  45.88 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  42.94 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  47.51 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  47.51 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  50.27 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  48.89 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  49.47 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  40.41 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  43.92 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  41.08 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  46.37 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  40.56 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  44.65 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  44.65 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  43.08 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  40.53 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  45.3 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  43.89 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  45.81 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  40.44 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  39.8 
 
 		 474 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  46.63 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  43.46 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  44.31 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  39.88 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  37.13 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  32.84 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  41.48 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  34.55 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  37.95 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  37.87 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  40.35 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  35.86 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  38.3 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  38.82 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  39.01 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  35.23 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.87 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  38.57 
 
 		 186 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.88 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  36.09 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  31.74 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  34.44 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  36.46 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.68 
 
 		 646 aa  88.2  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  35.91 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  32.62 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  33.93 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 		 264 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  35.92 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  34.58 
 
 		 248 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  30.64 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  33.65 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.71 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  34.43 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.66 
 
 		 239 aa  84.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.83 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  32.21 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.95 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  35.96 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  37.06 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.27 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.16 
 
 		 708 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  29.29 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.83 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.83 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  32.76 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  36.42 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.83 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>