46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4335 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  44.85 
 
 
233 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  40.93 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  43.52 
 
 
231 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  38.31 
 
 
257 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  37.86 
 
 
248 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  42.94 
 
 
167 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  36.79 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  36.41 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  35.94 
 
 
280 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  36.7 
 
 
197 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  33.85 
 
 
216 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  30.73 
 
 
238 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  31.96 
 
 
509 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
871 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  35.9 
 
 
232 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  31.96 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  26.53 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.11 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  26.83 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  21.54 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  22.28 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  28.07 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  24.72 
 
 
424 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  24.84 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.15 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
593 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.9 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  26.41 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
593 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.18 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  26.35 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  25.28 
 
 
447 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  22.91 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
221 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  24.08 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  22.58 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  23.04 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0700  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.54 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  23.78 
 
 
1072 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  24.02 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  31.46 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  24.17 
 
 
479 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  21.57 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  21.47 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>