28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1009 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1009  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 308 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0469  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  72.88 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0294161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6459  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.16 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1743  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.48 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1044  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.77 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2642  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.43 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0534  hypothetical protein  50.81 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.434063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0589  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.76 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4673  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.29 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1709  hypothetical protein  51.65 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.53026  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2372  hypothetical protein  30.18 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0333  xylose isomerase-like TIM barrel  25.7 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.601498  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  21.64 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1019  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.78 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0551  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.19 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4869  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.59 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1021  protein of unknown function DUF1080  24.76 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1018  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.15 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.66 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1662  xylose isomerase domain-containing protein  22.33 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.36383  hitchhiker  0.00346458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1020  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.77 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3402  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2598  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.68 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5791  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.864508  normal  0.0412869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0895  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  19.34 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1525  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.12 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.36 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31660  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.93 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>