32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0752 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  39.64 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  32.51 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  28 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  25.97 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  29.14 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  30.9 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  28.78 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  30.13 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  27.67 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  26.61 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  32.05 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  31.09 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  32.93 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  28.99 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  28 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0866  hypothetical protein  30.82 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1823  hypothetical protein  26.7 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  25.32 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2106  hypothetical protein  27.74 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.713081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1194  hypothetical protein  29.61 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0473748  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  23.12 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  25.83 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  23.74 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  34.06 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0924  hypothetical protein  25.62 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0250313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  26.06 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  28.4 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>