28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5218 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  37.56 
 
 
207 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  36.22 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  36.13 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  36.13 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  39.47 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  30.49 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  30.29 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  27.14 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  28.78 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  27.23 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  28.37 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  27.09 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  32.02 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  30.32 
 
 
223 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  29.51 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  29.57 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  26.98 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  25.29 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  23.36 
 
 
233 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  26.61 
 
 
232 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1519  hypothetical protein  26.54 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0301691  normal  0.400253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2544  hypothetical protein  32.35 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0505  hypothetical protein  29.14 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4771  secreted protein  25.68 
 
 
237 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  28.87 
 
 
226 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>