25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4184 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  33.18 
 
 
214 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  32.86 
 
 
206 aa  92  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  32.86 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  30.33 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  30.92 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  29.06 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  30.18 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  28.3 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  27.23 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  30.13 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  26.67 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  28.23 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  27.72 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  26.24 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  25.77 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  27.94 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  26.42 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  31.75 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7137  hypothetical protein  31.91 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1038  hypothetical protein  31.06 
 
 
224 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  24.44 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7138  hypothetical protein  28.71 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  25.56 
 
 
201 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>