17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3284 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0505  hypothetical protein  36.75 
 
 
224 aa  84.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  29.31 
 
 
223 aa  84.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4771  secreted protein  27.72 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218877 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0924  hypothetical protein  27.22 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0250313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  29.63 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  32.02 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  29.5 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  28.99 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  28.23 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0246  hypothetical protein  27.88 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  26.15 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  26.21 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  25.95 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  27.1 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1544  hypothetical protein  26.53 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0001225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>