17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2035 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  34.34 
 
 
194 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  28.71 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  28.79 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  29.67 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  26.94 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  27.09 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  31.43 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  30.14 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  31.09 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  26.64 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  26.24 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  25.89 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  26.89 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  26.87 
 
 
214 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  27.1 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>