27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11978 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  378  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  35.6 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  37.32 
 
 
207 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  35.33 
 
 
194 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  33.17 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  29.44 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  32.29 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  31.84 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  32.12 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  27.45 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  26.29 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  28.89 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  25.38 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  28.26 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  30.14 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  29.84 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0675  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  28.28 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1519  hypothetical protein  25.81 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0301691  normal  0.400253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0613  hypothetical protein  23 
 
 
263 aa  48.5  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  24.59 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  23.56 
 
 
232 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  26.63 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  25.41 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  24.15 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>