33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6432 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  40.59 
 
 
194 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  35.5 
 
 
207 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  35.32 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  31.31 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  34.54 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  29.61 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  29.44 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  31.87 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  31.43 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  25.36 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  27.1 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3350  hypothetical protein  23.96 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  25.12 
 
 
226 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  31.05 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  26.5 
 
 
233 aa  58.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0675  hypothetical protein  26.84 
 
 
230 aa  58.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  25.81 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  26.67 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  28.43 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  29.07 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  27.12 
 
 
204 aa  52  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  22.98 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  28.33 
 
 
206 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0613  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  26.55 
 
 
224 aa  45.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  26.09 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2238  hypothetical protein  26.79 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575909  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_002950  PG1823  hypothetical protein  32.8 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0924  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0250313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3744  hypothetical protein  24.42 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1519  hypothetical protein  26.2 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0301691  normal  0.400253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>