18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3557 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  32.86 
 
 
202 aa  92  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  29.37 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  33.63 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  28 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  32.79 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  35.29 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  25.16 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  26.09 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  29.57 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  29.27 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  28.22 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  30.19 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  30.33 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  31.21 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5810  hypothetical protein  25 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431058  normal  0.900204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>