16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5569 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  28.71 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  24.65 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  29.51 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  28.22 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  28.16 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  26.2 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  25.94 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  25.91 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  27.44 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  23.74 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  27.74 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  26.19 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  25.56 
 
 
202 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>