16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4195 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  31.46 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2056  hypothetical protein  32.52 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685673  normal  0.507771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  25.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  26.32 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  26 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  26.27 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1194  hypothetical protein  26.07 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0473748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6536  hypothetical protein  25.73 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2238  hypothetical protein  25.96 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575909  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  25.94 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  25.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  24.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  25.89 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  27.06 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4978  hypothetical protein  24.66 
 
 		 228 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal  0.718613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>