14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4978 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4978  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal  0.718613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0739  hypothetical protein  37.78 
 
 
227 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2827  hypothetical protein  33 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.959821  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3828  hypothetical protein  32.7 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00159806  normal  0.0338696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0931  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0574  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0661083  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1194  hypothetical protein  31.65 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0473748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  30.94 
 
 
213 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  23.7 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1095  hypothetical protein  28.43 
 
 
109 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0747  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  24.66 
 
 
226 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  29.01 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>