20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5362 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  417  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  31.31 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7137  hypothetical protein  30.87 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  27.47 
 
 
232 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0866  hypothetical protein  28.19 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  26.15 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7138  hypothetical protein  31.9 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  29 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  34.56 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  26.94 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  32.93 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  27.72 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2544  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  25.88 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  22.98 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  21.36 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  25.56 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1038  hypothetical protein  23.77 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  27.06 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1039  hypothetical protein  28.23 
 
 
228 aa  42  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>