20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11903 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  36.13 
 
 
192 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  33.14 
 
 
199 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  28.37 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  28.49 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  28.06 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  27.36 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  33.17 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  25.97 
 
 
214 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  29.71 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  25.84 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  25.98 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  26.73 
 
 
230 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  25.33 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  26.42 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  26.2 
 
 
201 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0613  hypothetical protein  21.76 
 
 
263 aa  42  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>