22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0865 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1823  hypothetical protein  30.62 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7137  hypothetical protein  33.96 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  33.62 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0866  hypothetical protein  30.62 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7138  hypothetical protein  30.9 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2106  hypothetical protein  29.91 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.713081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  30.05 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  28.37 
 
 
194 aa  55.1  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2041  hypothetical protein  26.26 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000603358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  26.56 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1038  hypothetical protein  28.66 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2544  hypothetical protein  28.02 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  26.04 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0779  hypothetical protein  25.27 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  26.75 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4052  hypothetical protein  26.97 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1405  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  34.06 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  26.48 
 
 
207 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>