19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0864 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0866  hypothetical protein  33.06 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  33.62 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  27.47 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1823  hypothetical protein  28.88 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  29.06 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  27.43 
 
 
186 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  26.16 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  26.61 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1038  hypothetical protein  28.39 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7137  hypothetical protein  25.25 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7138  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2544  hypothetical protein  25.76 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  28.08 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  29.96 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2041  hypothetical protein  24.41 
 
 
243 aa  51.6  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000603358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1039  hypothetical protein  25.94 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  26.61 
 
 
192 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2106  hypothetical protein  25.42 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.713081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>