More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0295 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4413  kynureninase  92.86 
 
 		 378 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  100 
 
 		 374 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  98.93 
 
 		 374 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  96.26 
 
 		 373 aa  744    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  80.48 
 
 		 373 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  80.21 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  80.48 
 
 		 373 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  80.21 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  76.74 
 
 		 373 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  68.56 
 
 		 371 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  63.56 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  61.2 
 
 		 381 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  60.22 
 
 		 371 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  38.75 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.17 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.23 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  29.75 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.59 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  29.27 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.8 
 
 		 368 aa  119  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  28.18 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.87 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.04 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  28.35 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1473  kynureninase  28.01 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.91 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  26.4 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7639  kynureninase  27.03 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  26.02 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5192  kynureninase  27.01 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.491737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  26.51 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  25.27 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  27.4 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2225  kynureninase  24.66 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.810346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  27.25 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  26.39 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  25.99 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3589  kynureninase  26.61 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  24.8 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  25.51 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  27.27 
 
 		 427 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  26.87 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  25.66 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.48 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  25.4 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1967  kynureninase  24.53 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2602  kynureninase  24.53 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2578  kynureninase  24.53 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.649182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  27.27 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5909  kynureninase  24.53 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  23.5 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2497  kynureninase  24.36 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.651765  normal  0.855444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  26.79 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  24.73 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2921  kynureninase  24.28 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2626  kynureninase  26.05 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  26.09 
 
 		 416 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  29.3 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  24.34 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  28.1 
 
 		 357 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  25.14 
 
 		 407 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.41 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0719  kynureninase  25.08 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76256  normal  0.281792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  25.48 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  24.65 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2164  kynureninase  30 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0484937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3019  kynureninase  25.57 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  25.87 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  26.37 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  30.17 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2523  kynureninase  23.88 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000799329  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  26.22 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2761  kynureninase  23.88 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186702 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5245  kynureninase  26.61 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.668711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2787  kynureninase  23.76 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00906384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2559  kynureninase  23.36 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0488118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2766  kynureninase  23.62 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.05 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2567  kynureninase  23.62 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.69 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2753  kynureninase  23.62 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2808  kynureninase  22.83 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  24.43 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2488  kynureninase  23.36 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.819206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  22.81 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1885  kynureninase  28.51 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02180  Kynureninase  24.79 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.641919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  24.6 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1518  kynureninase  24.8 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0681881  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  23.75 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  25.7 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  25.88 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  26.97 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1156  kynureninase  29.44 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0242  kynureninase  30.04 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2439  kynureninase  24.07 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>