30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4357 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  49.62 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  30.59 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  25.93 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.3 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  34.68 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  27.23 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  30.83 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  27.11 
 
 		 165 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  30.64 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  41.43 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  29.7 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  33 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.17 
 
 		 182 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  30.3 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  29.46 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  34.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  34.91 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  29.36 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  31.73 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  30.15 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  29.75 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  29.31 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  30.47 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  31.43 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  25.33 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.97 
 
 		 177 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  32.5 
 
 		 147 aa  42  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>