31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1991 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  99.04 
 
 
311 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  49.84 
 
 
304 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  95.1 
 
 
146 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  46.9 
 
 
307 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  46.08 
 
 
305 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  45.36 
 
 
308 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  47.18 
 
 
307 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  47.04 
 
 
310 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  48.01 
 
 
305 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  40.89 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  40.21 
 
 
307 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  41.16 
 
 
304 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  41.69 
 
 
306 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  41 
 
 
318 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  40 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  37.29 
 
 
330 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  36.27 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  37.67 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  36.9 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  34.95 
 
 
284 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  46.54 
 
 
199 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  39.16 
 
 
304 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  27.45 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.03 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  71.05 
 
 
84 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  63.41 
 
 
65 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  25.73 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  26.78 
 
 
271 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>