80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0658 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  239  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  92.17 
 
 		 115 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  91.96 
 
 		 119 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  80.53 
 
 		 121 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  71.82 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  70 
 
 		 120 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  67.86 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  55.24 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3583  thioredoxin domain-containing protein  48.6 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0732  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0886  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  36.54 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  34.62 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  34.31 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.43 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  30.69 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.57 
 
 		 310 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  33.77 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  29.03 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  30.86 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  32.47 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  25.77 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  27.96 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  32.47 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  29.52 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.52 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.62 
 
 		 280 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  25.24 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0471  Thioredoxin domain  28.75 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  30.21 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.83 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  28.92 
 
 		 280 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  26.67 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  27 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  30.95 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  27.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  25.93 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  32.14 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.35 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  25.56 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  31.87 
 
 		 282 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  33.33 
 
 		 547 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  29.11 
 
 		 555 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  29.49 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  26.14 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  27.66 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  32 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  26.14 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  29.63 
 
 		 329 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  30.86 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  28.4 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  28.92 
 
 		 286 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  31.25 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  28.21 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  25 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  29 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  25 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  26.92 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  26.92 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  28.42 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  24.32 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 570 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  27.03 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.27 
 
 		 304 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  30.16 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0833552 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  29.87 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  30.88 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  23.16 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  22.58 
 
 		 140 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  22.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  22.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  22.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  22.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  22.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>