71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  30.88 
 
 
294 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1228  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0136245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
271 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.94 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.94 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1039  hypothetical protein  32.67 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000480013  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.33 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  40 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  25.68 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  25.5 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  25.5 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0743  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.999893  normal  0.843892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.67 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  34.15 
 
 
276 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
278 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  31.86 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.19 
 
 
287 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  25.95 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.48 
 
 
387 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
281 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  26.72 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  23.03 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  25.78 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.77 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  31.78 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.34 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.2 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  22.81 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.8 
 
 
256 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  24.81 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.12 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.84 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
471 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  30.25 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.1 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  32.35 
 
 
214 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
246 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  25.97 
 
 
252 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  25.97 
 
 
252 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  36.61 
 
 
252 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.97 
 
 
252 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.97 
 
 
252 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.97 
 
 
252 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.6 
 
 
256 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.8 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
250 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.37 
 
 
252 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  41.94 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  21.15 
 
 
290 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.37 
 
 
258 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
328 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  26.47 
 
 
218 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  33.8 
 
 
201 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>