65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4766 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  70.48 
 
 		 294 aa  317  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  65.71 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  66.12 
 
 		 225 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  44.51 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  40.31 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  31.84 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  32.37 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  32.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  32.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  32.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  32.71 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  32.71 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  32.71 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  29.94 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  26.44 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.62 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  29.09 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.93 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  34.07 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  30.56 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  36.36 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0323  methyltransferase  30.11 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  30.11 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  34.29 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  29.06 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.87 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.87 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.87 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  41.82 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1326  methyltransferase  33.87 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.87 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.56 
 
 		 442 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  29.06 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1367  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  34.62 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  29.06 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  29.06 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  41.38 
 
 		 449 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  41.38 
 
 		 463 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  42.22 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  30.11 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  30.11 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  30.5 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4836  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 332 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  30.11 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.66 
 
 		 463 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  27.86 
 
 		 224 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  36.76 
 
 		 207 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  30.11 
 
 		 202 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  40.74 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.15 
 
 		 246 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  27.52 
 
 		 503 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  41.6  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 634 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1499  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.26 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>