49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0653 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  50 
 
 
235 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  36.23 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  29.38 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  29.38 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  33.64 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  29.38 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  31.58 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  34.84 
 
 
172 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  30.94 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  26.01 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  28.11 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  24.5 
 
 
195 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  28.92 
 
 
225 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2883  hypothetical protein  26.73 
 
 
238 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  28.97 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17302  predicted protein  33.61 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.444281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  28.87 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
413 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.16 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  30 
 
 
199 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  36.47 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  25.16 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  25.16 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  25.16 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.46 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  25.16 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.14 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.93 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  25.32 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47512  predicted protein  38.6 
 
 
733 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  25.32 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  26.67 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  29.75 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  29.17 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.15 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  29.23 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  21.99 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.6 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1039  hypothetical protein  22.3 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000480013  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1717  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  24.05 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.61 
 
 
208 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1755  methyltransferase small  33.75 
 
 
344 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000164104  normal  0.0951984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>