34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4418 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  31.72 
 
 
249 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  40.3 
 
 
172 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  34.91 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  37.78 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  37.78 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  37.78 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  37.78 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  37.78 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  37.78 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  30.16 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  32.57 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  24.61 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  28.88 
 
 
251 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  27.95 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  28.57 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  26.71 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  35.79 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  26.92 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  28.21 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  26.92 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  28.21 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0313  methyltransferase  26.45 
 
 
201 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.456106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  26.45 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1228  hypothetical protein  23.24 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0136245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1039  hypothetical protein  23.24 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000480013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2070  methyltransferase type 12  39.53 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92721  predicted protein  26.53 
 
 
336 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0023246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>