55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1387 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  40.43 
 
 		 294 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  44.51 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  42.11 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  40.23 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  31.41 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  32.52 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  39.2 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  23.68 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  35.56 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  32.18 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  37.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  37.93 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  37.93 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  37.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  37.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  37.93 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  33.01 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  26.62 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1397  hypothetical protein  34.45 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  36.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.03 
 
 		 297 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  30.3 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.21 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.03 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  34.23 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.7 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.14 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  29.29 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  29.1 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.71 
 
 		 295 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  28.47 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  29.1 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  29.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  29.1 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.35 
 
 		 304 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.89 
 
 		 302 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 341 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  34.12 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 268 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 244 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.85 
 
 		 293 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 252 aa  42  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 277 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 199 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  26.53 
 
 		 298 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  31.31 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 		 296 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.78 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>