34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2525 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  348  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  40.3 
 
 
229 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  36.69 
 
 
249 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  39.01 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
223 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  34.88 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  33.87 
 
 
294 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  36.75 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  36.75 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  36.75 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  36.75 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  36.75 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  36.75 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  36.89 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  28.35 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  31.15 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  28.04 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  28.04 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  28.04 
 
 
202 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  28.04 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  26.81 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0323  methyltransferase  27.87 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  28.04 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  28.04 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  28.48 
 
 
202 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  27.1 
 
 
202 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.86 
 
 
241 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  31.45 
 
 
727 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0313  methyltransferase  25.76 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.456106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  32.52 
 
 
727 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  31.67 
 
 
727 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>