33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1724 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  33.72 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  28.35 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  27.61 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  28.74 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  26.01 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  24.61 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  28.24 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  27.17 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1039  hypothetical protein  22.98 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000480013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0323  methyltransferase  25.95 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0313  methyltransferase  25.95 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.456106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1228  hypothetical protein  22.98 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0136245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  26.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  25.49 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  24.68 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  24.68 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  24.05 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  25.93 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  25.93 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  25.93 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>