27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1039 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1039  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000480013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1228  hypothetical protein  99.03 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0136245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0313  methyltransferase  51.74 
 
 
201 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.456106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0323  methyltransferase  51.74 
 
 
202 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  52.5 
 
 
202 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  51.5 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  52 
 
 
202 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  50.75 
 
 
201 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  51.74 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  51.74 
 
 
202 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  51.24 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  51.24 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  51.24 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  23.23 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  22.09 
 
 
235 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  22.09 
 
 
235 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  22.09 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  22.09 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  22.09 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  23.31 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  22.98 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.67 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221823  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  23.86 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  23.24 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  22.3 
 
 
252 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  21.35 
 
 
284 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>