126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  100 
 
 
529 aa  1096    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1092  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000472494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  32.39 
 
 
560 aa  233  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1013  oxidoreductase molybdopterin binding  33.62 
 
 
599 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14191  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  30.34 
 
 
539 aa  211  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  29.26 
 
 
535 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  26.45 
 
 
552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  27.39 
 
 
521 aa  116  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.334834  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  27.96 
 
 
360 aa  93.6  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  26.84 
 
 
359 aa  93.2  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  27.24 
 
 
357 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  29.13 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.372289  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16780  sulfite oxidase-like oxidoreductase  29.83 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.610919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.18 
 
 
505 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  27.05 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  27.05 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  27.34 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  40.96 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0299  oxidoreductase molybdopterin binding  27.88 
 
 
270 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  24.76 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  26.87 
 
 
554 aa  64.3  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  25.54 
 
 
369 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16770  hypothetical protein  38.16 
 
 
92 aa  63.9  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.711837  normal  0.749784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.81 
 
 
512 aa  63.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.36 
 
 
501 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 
426 aa  63.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  25.37 
 
 
501 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.95 
 
 
525 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  28.76 
 
 
406 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  24.44 
 
 
343 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  28.85 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  26.82 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.28 
 
 
511 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.86 
 
 
416 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.85 
 
 
465 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  28.45 
 
 
405 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  28.45 
 
 
405 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  25.64 
 
 
489 aa  60.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  22.44 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0300  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.65 
 
 
92 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  26.92 
 
 
448 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  24.78 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.22 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  27.96 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  24.49 
 
 
534 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  26.39 
 
 
546 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  25.45 
 
 
457 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.95 
 
 
505 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.69 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.69 
 
 
418 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
524 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.24 
 
 
520 aa  57.4  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.22 
 
 
508 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  24.54 
 
 
420 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.92 
 
 
411 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  26.18 
 
 
407 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.53 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.53 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.53 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  27 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.75 
 
 
369 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.43 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  30.43 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.1 
 
 
430 aa  55.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  27.35 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  26.32 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  25.37 
 
 
457 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  28.22 
 
 
403 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  28.22 
 
 
402 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  26.7 
 
 
369 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  23.81 
 
 
414 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  25.85 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  25.28 
 
 
445 aa  53.5  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  24.8 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  25.59 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  26.67 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  25.66 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.32 
 
 
508 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.92 
 
 
532 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.22 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  25.38 
 
 
542 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  26.16 
 
 
424 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  24.14 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  24.21 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  24.91 
 
 
419 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.41 
 
 
521 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  23.33 
 
 
408 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  28.26 
 
 
608 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  30.91 
 
 
1016 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  24.28 
 
 
425 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  23.43 
 
 
408 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  24.03 
 
 
528 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  24.13 
 
 
414 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.33 
 
 
512 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  27.54 
 
 
414 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.34 
 
 
419 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.22 
 
 
515 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>