More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4220 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  98.36 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  97.13 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  38.29 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  38.66 
 
 
273 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  39.02 
 
 
273 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  39.7 
 
 
273 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  39.02 
 
 
273 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  39.02 
 
 
273 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  38.63 
 
 
274 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  38.58 
 
 
273 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  37.45 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  35.96 
 
 
272 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  35.96 
 
 
272 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  35.96 
 
 
272 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  37.08 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  35.45 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  36.7 
 
 
272 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  36.43 
 
 
272 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  35.56 
 
 
286 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  35.56 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  35.56 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  35.56 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  35.93 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  37.08 
 
 
273 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  32.18 
 
 
274 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  34.1 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
273 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.6 
 
 
268 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0231  Cof-like hydrolase  30.65 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.21 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 
274 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
277 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  28.41 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.55 
 
 
277 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1231  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
249 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.56 
 
 
279 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.19 
 
 
279 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  27.44 
 
 
274 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  27.21 
 
 
272 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.09 
 
 
269 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.09 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  26.82 
 
 
281 aa  99.4  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.29 
 
 
273 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.09 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.63 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  28.09 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  28.09 
 
 
271 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 
460 aa  96.3  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  29.07 
 
 
270 aa  95.5  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.24 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 
274 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 
274 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  27.55 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  30.27 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  27.2 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  26.48 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  27.1 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.59 
 
 
273 aa  89  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  25.57 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
270 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  24.09 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.26 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  26.04 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.67 
 
 
282 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  27.92 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  27.69 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  27.52 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 
273 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 
274 aa  85.5  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.39 
 
 
269 aa  85.5  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  30.2 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  26.62 
 
 
282 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  26.81 
 
 
286 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  27.13 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  27.13 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  27.13 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  27.07 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>