261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4706 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  100 
 
 		 326 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  79.38 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  45.52 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  43.14 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  39.44 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0064  putative thymidylate synthase protein  34.83 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1475  putative thymidylate synthase  34.83 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.190505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1563  putative thymidylate synthase  34.83 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1454  thymidylate synthase  30.36 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1303  deoxyuridylate hydroxymethyltransferase, putative  33.79 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  32.75 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  25.21 
 
 		 264 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  25.41 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  25.1 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  24.9 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  25.42 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  25.74 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  24.9 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  26.12 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  26.2 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  26.2 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  24.39 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  26.61 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  25.71 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  23.97 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  24.66 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  23.5 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  25.1 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  25.94 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  24.8 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  24.89 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  24.8 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  24.43 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  23.75 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  24.68 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  23.17 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  25.37 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  23.98 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  24.7 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  24.48 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  24.34 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  25.73 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  23.87 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  24 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  26.89 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  24.39 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  23.85 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  23.67 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  25.53 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  23.71 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  25.97 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  27.72 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  23.67 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  24.3 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  24.55 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  24.5 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  24.26 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  22.31 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  24.26 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  23.76 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  24.63 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  22.91 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  24.26 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  24.11 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0572  thymidylate synthase  23.68 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  24.75 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  23.98 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  22.86 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  23.74 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  23.71 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  23.85 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  23.83 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  25.1 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  23.27 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  23.61 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  23.85 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  25.36 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  25.36 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  23.85 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  22.56 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  24.59 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  25.91 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  23.76 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0544  thymidylate synthase  24.77 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.249699  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  26.19 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>