63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3131 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  190  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  95.79 
 
 		 95 aa  186  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  87.63 
 
 		 97 aa  176  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  88.66 
 
 		 97 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  87.63 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  85.57 
 
 		 97 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  85.11 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  84.04 
 
 		 94 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  77.42 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  77.42 
 
 		 96 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  72.92 
 
 		 99 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  77.42 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  77.66 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  67.37 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  67.03 
 
 		 120 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  69.23 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  65.59 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  65.26 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  65.93 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  67.78 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  65.93 
 
 		 98 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  67.03 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  63.74 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  60.44 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  59.09 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  54.74 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00873  CRISPR-associated protein Cas2  71.43 
 
 		 59 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.745385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.67 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1287  CRISPR-associated protein Cas2  44.32 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  41.94 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  40.86 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2686  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  38.3 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3903  CRISPR-associated protein Cas2  41.38 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0712399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17200  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1529  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00270035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  37.89 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  41.05 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.77 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3048  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000244697  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2637  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.24 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0851527  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0982  CRISPR-associated protein Cas2  39.77 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.78 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17290  CRISPR-associated protein, Cas2 family  36.36 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1412  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00285914  normal  0.0632504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17240  hypothetical protein  60.53 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2165  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0152401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.36 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3771  hypothetical protein  51.28 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  36.26 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0905  CRISPR-associated protein Cas2  26.14 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.505656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  33.68 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  35.79 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  38.03 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.63 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>