52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2579 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 
136 aa  281  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1287  CRISPR-associated protein Cas2  58.62 
 
 
116 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3903  CRISPR-associated protein Cas2  58.26 
 
 
116 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0712399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2686  CRISPR-associated protein Cas2  56.03 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1529  CRISPR-associated protein Cas2  54.7 
 
 
116 aa  133  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00270035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3048  CRISPR-associated protein Cas2  49.19 
 
 
124 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000244697  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0982  CRISPR-associated protein Cas2  52.17 
 
 
92 aa  100  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  42.59 
 
 
359 aa  88.2  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17290  CRISPR-associated protein, Cas2 family  46.67 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.94 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  40.78 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.82 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  40.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  41.57 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  38.55 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  37.93 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  34.09 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  34.09 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  37.93 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  37.93 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  39.08 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  35.64 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  37.93 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  35.63 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  36.78 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  39.08 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  36.78 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  39.08 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  36.13 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17200  CRISPR-associated protein Cas2  36.78 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  36.19 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  37.93 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  34.74 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  36.78 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  31.96 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  36.78 
 
 
120 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2637  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.29 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0851527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  35.63 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  31.03 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  31.63 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  31.13 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>