31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0785 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 
109 aa  215  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  88.99 
 
 
109 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.94 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  54.64 
 
 
97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  56.25 
 
 
98 aa  106  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  53.68 
 
 
103 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 
97 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  51.55 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  41.1 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  41.1 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  42.25 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  37.08 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  43.24 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  40.85 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  40.79 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  35 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  40.85 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  43.66 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  37.89 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  39.44 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  39.44 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  40.58 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  38.03 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  34.74 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  43.55 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  39.13 
 
 
97 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.13 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  36 
 
 
98 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>