36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0348 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 107 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  64.58 
 
 		 97 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  56.84 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  50.94 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  50.94 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  45.54 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  39.36 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  39.36 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  39.36 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  39.36 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  39.13 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  39.36 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  39.36 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  40.43 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  37.23 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  37.23 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  37.76 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  39.13 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  38.14 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  36.96 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  32.26 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  31.37 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  34.04 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  33.68 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  34.78 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  36.96 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  28.97 
 
 		 359 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  34.31 
 
 		 115 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>