35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0487 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  47.37 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  48.45 
 
 		 97 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  49.48 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.54 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  51.55 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.45 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  49.5 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  32.79 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  39.33 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  35.79 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  38.04 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.84 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  34.04 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  34.04 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  35.87 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  32.98 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  32.22 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  31.91 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  34.41 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  34.41 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  34.31 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  34.44 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>