30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0929.1 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 97 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  73.2 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  55.21 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  53.12 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  48.42 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  49.48 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  39.78 
 
 		 94 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  38.71 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  41.94 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  35.79 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  40.86 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.56 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  38.46 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  32.97 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.56 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  29.03 
 
 		 90 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  40 
 
 		 359 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>