36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3221 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  64.58 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  55.79 
 
 		 103 aa  116  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  54.64 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  53.12 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  51.04 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  52.08 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  48.45 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  37.89 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  36.84 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  36.73 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  36.73 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  47.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  35.79 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  37.89 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  36.56 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  30.21 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  35.05 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  35.48 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  26.32 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.58 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.17 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.7 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.63 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>