63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0233 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  199  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  83.16 
 
 
105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  80.85 
 
 
97 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  79.79 
 
 
97 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  79.79 
 
 
96 aa  154  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  80.85 
 
 
94 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  79.79 
 
 
94 aa  153  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  77.66 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  77.66 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  77.66 
 
 
97 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  77.66 
 
 
97 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  77.66 
 
 
97 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  76.6 
 
 
97 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  78.26 
 
 
95 aa  148  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  78.26 
 
 
95 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  71.88 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  72.34 
 
 
98 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  65.62 
 
 
97 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  64.89 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  63.16 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  60.64 
 
 
102 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  63.04 
 
 
98 aa  121  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  62.64 
 
 
98 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  64.13 
 
 
115 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  60.87 
 
 
102 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  63.04 
 
 
98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  59.78 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  57.61 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  57.61 
 
 
92 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  57.45 
 
 
102 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  53.41 
 
 
93 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  43.18 
 
 
126 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00873  CRISPR-associated protein Cas2  75.47 
 
 
59 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.745385  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1287  CRISPR-associated protein Cas2  43.18 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  39.36 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3903  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0712399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1529  CRISPR-associated protein Cas2  40.45 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00270035  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0982  CRISPR-associated protein Cas2  40.45 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  41.05 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17200  CRISPR-associated protein Cas2  38.89 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  40.66 
 
 
359 aa  70.9  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  40 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2686  CRISPR-associated protein Cas2  37.08 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3048  CRISPR-associated protein Cas2  40.91 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000244697  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2637  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.46 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0851527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  41.57 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  38.2 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17290  CRISPR-associated protein, Cas2 family  40.23 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.23 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17240  hypothetical protein  63.16 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2165  CRISPR-associated protein Cas2  27.27 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0152401  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1412  CRISPR-associated protein Cas2  27.27 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00285914  normal  0.0632504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.76 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0905  CRISPR-associated protein Cas2  28.09 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.505656  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3771  hypothetical protein  46.51 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  31.91 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  37.89 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  37.89 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.79 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 
103 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  32.63 
 
 
97 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>