63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3120 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4007  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.396918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3120  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2882  hypothetical protein  97.89 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3248  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271107  normal  0.862142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3131  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3065  hypothetical protein  95.79 
 
 		 95 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0404  CRISPR-associated protein Cas2  86.6 
 
 		 97 aa  177  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  87.63 
 
 		 97 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  86.6 
 
 		 97 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  170  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  87.23 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  86.17 
 
 		 94 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2990  CRISPR-associated Cas2 family protein  76.84 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.2106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  76.29 
 
 		 96 aa  153  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  77.42 
 
 		 98 aa  151  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0233  hypothetical protein  77.66 
 
 		 98 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  72.92 
 
 		 99 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  67.37 
 
 		 97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1393  hypothetical protein  69.23 
 
 		 101 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2831  hypothetical protein  64.52 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0837  hypothetical protein  65.93 
 
 		 102 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2336  hypothetical protein  65.59 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000986814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  65.93 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1374  hypothetical protein  63.16 
 
 		 97 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0105683  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1601  CRISPR-associated protein Cas2  66.67 
 
 		 98 aa  130  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0865232  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0421  CRISPR-associated protein Cas2  65.93 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0703097  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  62.64 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0600  hypothetical protein  59.34 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000609963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0168  hypothetical protein  59.09 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5408  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0929  CRISPR-associated protein Cas2  56.38 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.525639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00873  CRISPR-associated protein Cas2  76.36 
 
 		 59 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.745385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1287  CRISPR-associated protein Cas2  45.45 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1978  CRISPR-associated Cas2 family protein  42.39 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3012  CRISPR-associated protein Cas2  43.18 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0235864  decreased coverage  0.00725817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2686  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  44.83 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1237  CRISPR-associated protein Cas2  42.05 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0022864  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0947  CRISPR-associated protein Cas2  37.76 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3903  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0712399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  42.53 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  38.95 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17200  CRISPR-associated protein Cas2  40 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1529  CRISPR-associated protein Cas2  39.08 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00270035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0024  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.77 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.782096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3048  CRISPR-associated protein Cas2  37.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000244697  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1902  CRISPR-associated protein Cas2  41.05 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2637  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.24 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0851527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2579  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.93 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0586596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17290  CRISPR-associated protein, Cas2 family  36.36 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0982  CRISPR-associated protein Cas2  38.64 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1412  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00285914  normal  0.0632504 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2165  CRISPR-associated protein Cas2  28.41 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0152401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17240  hypothetical protein  57.89 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.36 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3771  hypothetical protein  44.68 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0905  CRISPR-associated protein Cas2  26.14 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.505656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  34.78 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  36.26 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  35.79 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  40.85 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  39.44 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.63 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>