21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0948 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0948  CRISPR-associated Cas2 family protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0426213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0929.1  CRISPR-associated Cas2 family protein  73.2 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0348  CRISPR-associated Cas2 family protein  55.21 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0785  CRISPR-associated protein Cas2  56.25 
 
 		 109 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2235  CRISPR-associated protein Cas2  52.63 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0785  CRISPR-associated protein Cas2  54.17 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140792  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3221  cas2: CRISPR-associated protein Cas2  52.08 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.836191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0487  CRISPR-associated protein Cas2  48.45 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0934  CRISPR-associated protein Cas2  37.63 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0958  hypothetical protein  37.63 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3091  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3147  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.886022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3754  hypothetical protein  36.56 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.369105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2445  CRISPR-associated protein Cas2  29.03 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4087  CRISPR-associated protein Cas2  31.18 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0728059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0965  hypothetical protein  35.16 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3540  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.56 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal  0.0703067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2472  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3584  CRISPR-associated protein Cas2  35.48 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1593  hypothetical protein  33.68 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243436  normal  0.417431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>